Как и другие юношеские работы Боттичелли, «Мадонна с Младенцем и Иоанном Крестителем» (Галерея Академии, Флоренция), написана в манере, заимствованной у его первого учителя, Филиппо Липпи. Юная Мария скромно опустила взор на Младенца, сидящего у нее на коленях. Она облачена в одеяния, в котором ее традиционно изображали – красное платье и синий плащ. Боттичелли придел ее одеждам налет роскоши. Дорогой бархатный плащ отделан золотой тесьмой, нежное лицо Мадонны обрамляют складки полупрозрачной вуали, уходящей под ворот плаща. Признаки незрелой кисти молодого художника ощущается в жесткости драпировок тканей одежд Богородицы, пелен Младенца. Однако с большим талантом передана атмосфера умиротворения, нежной материнской любви и чистоты Марии.
С благоговением опустил вниз взгляд Иоанн Креститель, как и Мадонна. Боттичелли изобразил его, вопреки традиции и Писанию, в отроческом возрасте, как и ангелов. Один из них, скосив глаза, взирает на зрителей. Младенец и второй ангел устремляют свои взгляды на Марию, причем на лице ангела слева, поддерживающего Младенца, написано живое выражение, детский восторг, удивление. Иоанн Креститель изящным жестом придерживает в руках традиционный атрибут – тонкий вытянутый крест, и также по традиции, облачен в одежду из верблюжьего волоса, верх которой отделан воротничком.
На картине присутствует попытка Боттичелли передать движение. Если обратить внимание на фигуру Младенца, можно отметить, что его поза несколько неестественна и неустойчива, но с каким мастерством удалось передать его жест. Он тянет руки к Матери, словно пытается ухватить за край плаща, словно художник запечатлел миг до того, как его пухлые пальчики ухватят ткань крепкой хваткой.
В отличие от других картин этого периода, художник на заднем плане поместил только небо, голубое и безоблачное. Нет ни пейзажа, ни архитектурных сооружений, ни сада, ни горы, никаких других традиционных символов, кроме тесной группы из пяти фигур на переднем плане. Ярким пятном выделяется в нижнем правом углу декоративное украшение сиденья, на котором расположилась Мадонна, в виде головы младенца и резного крыла – все красного цвета.